Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TOP3AQ13472 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms