Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MKRN4PQ13434 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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