Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLDN16Q9Y5I7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLDN16Q9Y5I7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms