Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATG4BQ9Y4P1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms