Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M1Q9Y2T2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms