Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms