Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX6Q9UNH7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms