Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPCN1Q9ULQ1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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