Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms