Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHF11Q9UIL8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms