Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms