Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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