Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHPF2Q9P2E5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms