Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN3Q9P232 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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