Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms