Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP5Q9NZZ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms