Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms