Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms