Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSJ1

ZNF355P, Putative zinc finger protein 355P, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF355PQ9NSJ1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF355PQ9NSJ1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms