Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HELLSQ9NRZ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELLSQ9NRZ9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms