Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C8orf4Q9NR00 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms