Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA4BQ9NPR2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA4BQ9NPR2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms