Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN28AQ9H9Z2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms