Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00574Q9H8X3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms