Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP44Q9H0E7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms