Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRCC1Q9C099 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRCC1Q9C099 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms