Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMES1Q9C002 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMES1Q9C002 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms