Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSDMCQ9BYG8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms