Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIFKQ9BYG3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms