Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CDHR2Q9BYE9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR2Q9BYE9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms