Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2AFJQ9BTM1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms