Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RHOXF2Q9BQY4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RHOXF2Q9BQY4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RHOXF2Q9BQY4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RHOXF2Q9BQY4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms