Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FYCO1Q9BQS8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms