Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITX2Q99697 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms