Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP19Q99542 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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