Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAT1Q99536 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms