Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EYA3Q99504 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms