Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRBNQ96SW2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms