Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPR78Q96P69 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPR78Q96P69 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms