Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms