Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20AQ96MK3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms