Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf85Q96MD7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C9orf85Q96MD7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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