Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPNS2Q96L46 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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