Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms