Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM71F1Q96KD3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms