Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP47Q96K76 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP47Q96K76 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms