Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG3Q96JB2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms