Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL1Q96FI4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms