Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms