Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP4CQ96CF2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP4CQ96CF2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms